Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPRTO14522 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRTO14522 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
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