Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EBAG9O00559 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms