Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRDCB7Z8K6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms