Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALM3A6NDB9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms