Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
V9GYV3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
V9GYV3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
V9GYV3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
V9GYV3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
V9GYV3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
V9GYV3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
V9GYV3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
V9GYV3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
V9GYV3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
V9GYV3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
V9GYV3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYV3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYV3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYV3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYV3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
V9GYV3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYV3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYV3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYV3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYV3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYV3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
V9GYV3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYV3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYV3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYV3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
V9GYV3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYV3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYV3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYV3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYV3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYV3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
V9GYV3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYV3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYV3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYV3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYV3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYV3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYV3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYV3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
V9GYV3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYV3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYV3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYV3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYV3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
V9GYV3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYV3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYV3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYV3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYV3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYV3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYV3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYV3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYV3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYV3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYV3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYV3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYV3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYV3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYV3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYV3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYV3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYV3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYV3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYV3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYV3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYV3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYV3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYV3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYV3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYV3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYV3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYV3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYV3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYV3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYV3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYV3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYV3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYV3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYV3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYV3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYV3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYV3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYV3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYV3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYV3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYV3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYV3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYV3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYV3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYV3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
V9GYV3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
V9GYV3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
V9GYV3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
V9GYV3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
V9GYV3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
V9GYV3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
V9GYV3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
V9GYV3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
V9GYV3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms