Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A3GALT2U3KPV4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A3GALT2U3KPV4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
A3GALT2U3KPV4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A3GALT2U3KPV4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms