Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAD1L1Q9Y6D9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MAD1L1Q9Y6D9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAD1L1Q9Y6D9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAD1L1Q9Y6D9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAD1L1Q9Y6D9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAD1L1Q9Y6D9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAD1L1Q9Y6D9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAD1L1Q9Y6D9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAD1L1Q9Y6D9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAD1L1Q9Y6D9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAD1L1Q9Y6D9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAD1L1Q9Y6D9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAD1L1Q9Y6D9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MAD1L1Q9Y6D9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAD1L1Q9Y6D9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAD1L1Q9Y6D9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAD1L1Q9Y6D9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MAD1L1Q9Y6D9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAD1L1Q9Y6D9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAD1L1Q9Y6D9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAD1L1Q9Y6D9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAD1L1Q9Y6D9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAD1L1Q9Y6D9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAD1L1Q9Y6D9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAD1L1Q9Y6D9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAD1L1Q9Y6D9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAD1L1Q9Y6D9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MAD1L1Q9Y6D9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAD1L1Q9Y6D9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAD1L1Q9Y6D9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAD1L1Q9Y6D9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAD1L1Q9Y6D9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAD1L1Q9Y6D9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAD1L1Q9Y6D9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAD1L1Q9Y6D9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAD1L1Q9Y6D9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAD1L1Q9Y6D9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAD1L1Q9Y6D9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAD1L1Q9Y6D9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAD1L1Q9Y6D9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms