Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RAD54BQ9Y620 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD54BQ9Y620 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD54BQ9Y620 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD54BQ9Y620 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD54BQ9Y620 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms