Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHB2Q9Y5E7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHB2Q9Y5E7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHB2Q9Y5E7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHB2Q9Y5E7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms