Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP15Q9Y4E8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP15Q9Y4E8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP15Q9Y4E8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms