Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MED16Q9Y2X0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED16Q9Y2X0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED16Q9Y2X0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MED16Q9Y2X0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms