Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1DQ9Y2S0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1DQ9Y2S0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
POLR1DQ9Y2S0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1DQ9Y2S0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1DQ9Y2S0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1DQ9Y2S0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1DQ9Y2S0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1DQ9Y2S0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1DQ9Y2S0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLR1DQ9Y2S0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1DQ9Y2S0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1DQ9Y2S0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1DQ9Y2S0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR1DQ9Y2S0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms