Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN8AQ9UQD0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN8AQ9UQD0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN8AQ9UQD0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN8AQ9UQD0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms