Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
SHANK2Q9UPX8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SHANK2Q9UPX8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SHANK2Q9UPX8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SHANK2Q9UPX8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SHANK2Q9UPX8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SHANK2Q9UPX8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SHANK2Q9UPX8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SHANK2Q9UPX8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SHANK2Q9UPX8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SHANK2Q9UPX8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SHANK2Q9UPX8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SHANK2Q9UPX8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SHANK2Q9UPX8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SHANK2Q9UPX8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
SHANK2Q9UPX8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SHANK2Q9UPX8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SHANK2Q9UPX8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
SHANK2Q9UPX8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SHANK2Q9UPX8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SHANK2Q9UPX8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SHANK2Q9UPX8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SHANK2Q9UPX8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SHANK2Q9UPX8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SHANK2Q9UPX8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SHANK2Q9UPX8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SHANK2Q9UPX8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SHANK2Q9UPX8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SHANK2Q9UPX8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SHANK2Q9UPX8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SHANK2Q9UPX8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
SHANK2Q9UPX8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SHANK2Q9UPX8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
SHANK2Q9UPX8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
SHANK2Q9UPX8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SHANK2Q9UPX8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
SHANK2Q9UPX8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SHANK2Q9UPX8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SHANK2Q9UPX8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SHANK2Q9UPX8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SHANK2Q9UPX8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SHANK2Q9UPX8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SHANK2Q9UPX8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SHANK2Q9UPX8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SHANK2Q9UPX8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SHANK2Q9UPX8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SHANK2Q9UPX8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SHANK2Q9UPX8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SHANK2Q9UPX8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
SHANK2Q9UPX8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SHANK2Q9UPX8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
SHANK2Q9UPX8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms