Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
AGTPBP1Q9UPW5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
AGTPBP1Q9UPW5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AGTPBP1Q9UPW5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AGTPBP1Q9UPW5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AGTPBP1Q9UPW5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms