Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC12A4Q9UP95 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC12A4Q9UP95 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC12A4Q9UP95 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC12A4Q9UP95 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC12A4Q9UP95 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC12A4Q9UP95 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC12A4Q9UP95 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC12A4Q9UP95 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC12A4Q9UP95 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC12A4Q9UP95 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC12A4Q9UP95 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC12A4Q9UP95 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC12A4Q9UP95 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC12A4Q9UP95 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC12A4Q9UP95 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC12A4Q9UP95 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC12A4Q9UP95 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC12A4Q9UP95 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC12A4Q9UP95 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC12A4Q9UP95 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC12A4Q9UP95 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms