Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ALKQ9UM73 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ALKQ9UM73 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
ALKQ9UM73 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ALKQ9UM73 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ALKQ9UM73 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ALKQ9UM73 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ALKQ9UM73 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
ALKQ9UM73 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ALKQ9UM73 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ALKQ9UM73 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ALKQ9UM73 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ALKQ9UM73 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ALKQ9UM73 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ALKQ9UM73 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ALKQ9UM73 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ALKQ9UM73 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ALKQ9UM73 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ALKQ9UM73 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ALKQ9UM73 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms