Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PADI3Q9ULW8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PADI3Q9ULW8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PADI3Q9ULW8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PADI3Q9ULW8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PADI3Q9ULW8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PADI3Q9ULW8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PADI3Q9ULW8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PADI3Q9ULW8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PADI3Q9ULW8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PADI3Q9ULW8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
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