Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PLXNB3Q9ULL4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLXNB3Q9ULL4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLXNB3Q9ULL4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PLXNB3Q9ULL4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms