Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
AMFRQ9UKV5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AMFRQ9UKV5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AMFRQ9UKV5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AMFRQ9UKV5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms