Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATPIF1Q9UII2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATPIF1Q9UII2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATPIF1Q9UII2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms