Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC24A2Q9UI40 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC24A2Q9UI40 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC24A2Q9UI40 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC24A2Q9UI40 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms