Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
SCN11AQ9UI33 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SCN11AQ9UI33 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCN11AQ9UI33 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SCN11AQ9UI33 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCN11AQ9UI33 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCN11AQ9UI33 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SCN11AQ9UI33 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SCN11AQ9UI33 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SCN11AQ9UI33 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SCN11AQ9UI33 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SCN11AQ9UI33 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCN11AQ9UI33 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCN11AQ9UI33 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SCN11AQ9UI33 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SCN11AQ9UI33 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SCN11AQ9UI33 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SCN11AQ9UI33 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SCN11AQ9UI33 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCN11AQ9UI33 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCN11AQ9UI33 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms