Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGI6

KCNN3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN3Q9UGI6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNN3Q9UGI6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNN3Q9UGI6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNN3Q9UGI6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms