Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNAJB4Q9UDY4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAJB4Q9UDY4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAJB4Q9UDY4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DNAJB4Q9UDY4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNAJB4Q9UDY4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNAJB4Q9UDY4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms