Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN8Q9UBY8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLN8Q9UBY8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CLN8Q9UBY8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms