Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DBF4Q9UBU7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DBF4Q9UBU7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DBF4Q9UBU7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DBF4Q9UBU7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
DBF4Q9UBU7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
DBF4Q9UBU7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
DBF4Q9UBU7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
DBF4Q9UBU7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
DBF4Q9UBU7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
DBF4Q9UBU7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DBF4Q9UBU7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
DBF4Q9UBU7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DBF4Q9UBU7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DBF4Q9UBU7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
DBF4Q9UBU7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
DBF4Q9UBU7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DBF4Q9UBU7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DBF4Q9UBU7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
DBF4Q9UBU7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
DBF4Q9UBU7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
DBF4Q9UBU7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
DBF4Q9UBU7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
DBF4Q9UBU7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
DBF4Q9UBU7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
DBF4Q9UBU7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
DBF4Q9UBU7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
DBF4Q9UBU7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
DBF4Q9UBU7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DBF4Q9UBU7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
DBF4Q9UBU7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DBF4Q9UBU7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DBF4Q9UBU7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DBF4Q9UBU7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
DBF4Q9UBU7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
DBF4Q9UBU7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
DBF4Q9UBU7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
DBF4Q9UBU7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
DBF4Q9UBU7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
DBF4Q9UBU7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
DBF4Q9UBU7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
DBF4Q9UBU7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
DBF4Q9UBU7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DBF4Q9UBU7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
DBF4Q9UBU7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
DBF4Q9UBU7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
DBF4Q9UBU7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
DBF4Q9UBU7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
DBF4Q9UBU7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
DBF4Q9UBU7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DBF4Q9UBU7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DBF4Q9UBU7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DBF4Q9UBU7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DBF4Q9UBU7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
DBF4Q9UBU7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DBF4Q9UBU7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms