Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM4

OPTC, Opticin, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTCQ9UBM4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
OPTCQ9UBM4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTCQ9UBM4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTCQ9UBM4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTCQ9UBM4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTCQ9UBM4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTCQ9UBM4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTCQ9UBM4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTCQ9UBM4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPTCQ9UBM4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPTCQ9UBM4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTCQ9UBM4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTCQ9UBM4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTCQ9UBM4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTCQ9UBM4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPTCQ9UBM4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPTCQ9UBM4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
OPTCQ9UBM4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPTCQ9UBM4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OPTCQ9UBM4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OPTCQ9UBM4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPTCQ9UBM4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms