Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE7Q9UBL6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE7Q9UBL6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPNE7Q9UBL6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPNE7Q9UBL6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CPNE7Q9UBL6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE7Q9UBL6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPNE7Q9UBL6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPNE7Q9UBL6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPNE7Q9UBL6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms