Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF1

MAGEC2, Melanoma-associated antigen C2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC2Q9UBF1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAGEC2Q9UBF1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MAGEC2Q9UBF1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAGEC2Q9UBF1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAGEC2Q9UBF1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAGEC2Q9UBF1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MAGEC2Q9UBF1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAGEC2Q9UBF1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAGEC2Q9UBF1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MAGEC2Q9UBF1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEC2Q9UBF1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEC2Q9UBF1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MAGEC2Q9UBF1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MAGEC2Q9UBF1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MAGEC2Q9UBF1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MAGEC2Q9UBF1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MAGEC2Q9UBF1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MAGEC2Q9UBF1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MAGEC2Q9UBF1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MAGEC2Q9UBF1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MAGEC2Q9UBF1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MAGEC2Q9UBF1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MAGEC2Q9UBF1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MAGEC2Q9UBF1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MAGEC2Q9UBF1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MAGEC2Q9UBF1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MAGEC2Q9UBF1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MAGEC2Q9UBF1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MAGEC2Q9UBF1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MAGEC2Q9UBF1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MAGEC2Q9UBF1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms