Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FRMD4AQ9P2Q2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
FRMD4AQ9P2Q2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMD4AQ9P2Q2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
FRMD4AQ9P2Q2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FRMD4AQ9P2Q2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FRMD4AQ9P2Q2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FRMD4AQ9P2Q2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FRMD4AQ9P2Q2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms