Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNQ9P2M7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNQ9P2M7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNQ9P2M7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNQ9P2M7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNQ9P2M7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNQ9P2M7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNQ9P2M7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNQ9P2M7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CGNQ9P2M7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CGNQ9P2M7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CGNQ9P2M7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CGNQ9P2M7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms