Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS18Q9P253 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS18Q9P253 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS18Q9P253 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS18Q9P253 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms