Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PHRF1Q9P1Y6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PHRF1Q9P1Y6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PHRF1Q9P1Y6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PHRF1Q9P1Y6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PHRF1Q9P1Y6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PHRF1Q9P1Y6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PHRF1Q9P1Y6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PHRF1Q9P1Y6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PHRF1Q9P1Y6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PHRF1Q9P1Y6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PHRF1Q9P1Y6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PHRF1Q9P1Y6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PHRF1Q9P1Y6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PHRF1Q9P1Y6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PHRF1Q9P1Y6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PHRF1Q9P1Y6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PHRF1Q9P1Y6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PHRF1Q9P1Y6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PHRF1Q9P1Y6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PHRF1Q9P1Y6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PHRF1Q9P1Y6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PHRF1Q9P1Y6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PHRF1Q9P1Y6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PHRF1Q9P1Y6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PHRF1Q9P1Y6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PHRF1Q9P1Y6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PHRF1Q9P1Y6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PHRF1Q9P1Y6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PHRF1Q9P1Y6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PHRF1Q9P1Y6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PHRF1Q9P1Y6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PHRF1Q9P1Y6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PHRF1Q9P1Y6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PHRF1Q9P1Y6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PHRF1Q9P1Y6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PHRF1Q9P1Y6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PHRF1Q9P1Y6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PHRF1Q9P1Y6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PHRF1Q9P1Y6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PHRF1Q9P1Y6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PHRF1Q9P1Y6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PHRF1Q9P1Y6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PHRF1Q9P1Y6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PHRF1Q9P1Y6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PHRF1Q9P1Y6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PHRF1Q9P1Y6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PHRF1Q9P1Y6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PHRF1Q9P1Y6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PHRF1Q9P1Y6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PHRF1Q9P1Y6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PHRF1Q9P1Y6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PHRF1Q9P1Y6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PHRF1Q9P1Y6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms