Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ09

UBAP1, Ubiquitin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1Q9NZ09 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBAP1Q9NZ09 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBAP1Q9NZ09 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBAP1Q9NZ09 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBAP1Q9NZ09 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms