Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MTMR4Q9NYA4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTMR4Q9NYA4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTMR4Q9NYA4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTMR4Q9NYA4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTMR4Q9NYA4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MTMR4Q9NYA4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MTMR4Q9NYA4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTMR4Q9NYA4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTMR4Q9NYA4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTMR4Q9NYA4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTMR4Q9NYA4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTMR4Q9NYA4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTMR4Q9NYA4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTMR4Q9NYA4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MTMR4Q9NYA4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTMR4Q9NYA4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTMR4Q9NYA4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MTMR4Q9NYA4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTMR4Q9NYA4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms