Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ING3Q9NXR8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ING3Q9NXR8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms