Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
MCM9Q9NXL9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MCM9Q9NXL9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCM9Q9NXL9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCM9Q9NXL9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MCM9Q9NXL9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCM9Q9NXL9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCM9Q9NXL9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
MCM9Q9NXL9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCM9Q9NXL9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCM9Q9NXL9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCM9Q9NXL9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCM9Q9NXL9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MCM9Q9NXL9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
MCM9Q9NXL9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCM9Q9NXL9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCM9Q9NXL9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCM9Q9NXL9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MCM9Q9NXL9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MCM9Q9NXL9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MCM9Q9NXL9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
MCM9Q9NXL9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MCM9Q9NXL9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCM9Q9NXL9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCM9Q9NXL9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCM9Q9NXL9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MCM9Q9NXL9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCM9Q9NXL9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCM9Q9NXL9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MCM9Q9NXL9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MCM9Q9NXL9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
MCM9Q9NXL9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MCM9Q9NXL9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms