Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RLIMQ9NVW2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RLIMQ9NVW2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLIMQ9NVW2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLIMQ9NVW2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms