Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH1

DNAJC11, DnaJ homolog subfamily C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC11Q9NVH1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAJC11Q9NVH1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJC11Q9NVH1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAJC11Q9NVH1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms