Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCMTD2Q9NV79 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCMTD2Q9NV79 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCMTD2Q9NV79 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCMTD2Q9NV79 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms