Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM39AQ9NV64 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM39AQ9NV64 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM39AQ9NV64 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms