Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00846Q9NV44 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00846Q9NV44 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00846Q9NV44 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms