Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD4L1Q9NU39 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXD4L1Q9NU39 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXD4L1Q9NU39 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD4L1Q9NU39 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD4L1Q9NU39 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD4L1Q9NU39 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD4L1Q9NU39 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD4L1Q9NU39 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD4L1Q9NU39 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXD4L1Q9NU39 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXD4L1Q9NU39 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXD4L1Q9NU39 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXD4L1Q9NU39 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXD4L1Q9NU39 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXD4L1Q9NU39 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD4L1Q9NU39 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD4L1Q9NU39 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD4L1Q9NU39 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD4L1Q9NU39 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD4L1Q9NU39 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FOXD4L1Q9NU39 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms