Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SALL1Q9NSC2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SALL1Q9NSC2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SALL1Q9NSC2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SALL1Q9NSC2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SALL1Q9NSC2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SALL1Q9NSC2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SALL1Q9NSC2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SALL1Q9NSC2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SALL1Q9NSC2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SALL1Q9NSC2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SALL1Q9NSC2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SALL1Q9NSC2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SALL1Q9NSC2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SALL1Q9NSC2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SALL1Q9NSC2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SALL1Q9NSC2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SALL1Q9NSC2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SALL1Q9NSC2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SALL1Q9NSC2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SALL1Q9NSC2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SALL1Q9NSC2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms