Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPRMQ9NS64 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RPRMQ9NS64 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPRMQ9NS64 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRMQ9NS64 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms