Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS40

KCNH7, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH7Q9NS40 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNH7Q9NS40 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNH7Q9NS40 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNH7Q9NS40 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNH7Q9NS40 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNH7Q9NS40 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNH7Q9NS40 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNH7Q9NS40 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNH7Q9NS40 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNH7Q9NS40 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNH7Q9NS40 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNH7Q9NS40 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNH7Q9NS40 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNH7Q9NS40 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH7Q9NS40 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH7Q9NS40 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH7Q9NS40 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH7Q9NS40 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH7Q9NS40 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNH7Q9NS40 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNH7Q9NS40 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNH7Q9NS40 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNH7Q9NS40 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNH7Q9NS40 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
KCNH7Q9NS40 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
KCNH7Q9NS40 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNH7Q9NS40 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNH7Q9NS40 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNH7Q9NS40 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNH7Q9NS40 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNH7Q9NS40 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNH7Q9NS40 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNH7Q9NS40 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNH7Q9NS40 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNH7Q9NS40 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNH7Q9NS40 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNH7Q9NS40 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNH7Q9NS40 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNH7Q9NS40 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNH7Q9NS40 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNH7Q9NS40 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNH7Q9NS40 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNH7Q9NS40 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNH7Q9NS40 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNH7Q9NS40 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNH7Q9NS40 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNH7Q9NS40 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNH7Q9NS40 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNH7Q9NS40 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNH7Q9NS40 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNH7Q9NS40 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNH7Q9NS40 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNH7Q9NS40 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNH7Q9NS40 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNH7Q9NS40 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms