Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VPS45Q9NRW7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VPS45Q9NRW7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS45Q9NRW7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS45Q9NRW7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS45Q9NRW7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms