Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
STRN4Q9NRL3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
STRN4Q9NRL3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
STRN4Q9NRL3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
STRN4Q9NRL3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms