Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQE9

HINT3, Histidine triad nucleotide-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINT3Q9NQE9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HINT3Q9NQE9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HINT3Q9NQE9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HINT3Q9NQE9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINT3Q9NQE9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms